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OpenCVには、いくつか有名なバグがあります。
バグの情報に関しては、こちらのページ
https://code.ros.org/trac/opencv/report
で確認できますが、私の知っている気になったバグは以下の通り
- cvErode/cvDilate
iterationsに２以上の値を指定すると、膨張/収縮の中心位置がずれる - 画像の読み込み（cvLoadImage、cv::imread）（Ver2.1）
大きな画像を開けない - Windows7 64bitでUSBカメラが使えない （Ver2.2）
などなど。
以前に使えていた物も、新しいバージョンではバグになるという、ソフト屋さんではやってはいけないような事もあるので、要注意ですね。